Заболяванията на вътрешните органи и системи дават рефлекторно отражение върху ходилата на човек. Всеки орган, жлеза или част от тялото имат свои рефлекторни точки на ходилото. Когато се открие болезнена рефлекторна точка това означава, че има нарушение в енергийния поток на тялото и води до увреждане на всички структури на съответната рефлекторна точка. Релаксацията и обезболяването са основните ефекти на Зонотерапията. Общото въздействие върху организма се изразява в подобряване на обменните процеси, възстановяване на енергийните канали и елиминиране на редица токсични продукти. Зонотерапията се прилага при заболявания на вътрешните органи и опорно-двигателния апарат, при главоболие, болки в стомаха, болки в мускулите, в областта на гърба и др.